Certificat de spécialisation Bio-informatique avancée

Les participants devront valider les différentes UE de cours (examen écrit : note 10/20 requise). RAPPEL du règlement : valider les enseignements et le projet avec une moyenne générale supérieure ou égale à 10/20, sans note inférieure à 8, dans un délai maximum de 4 ans

Le certification de spécialisation forme le ou la bio-informaticienne aux compétences qui lui permettront d'être autonome dans la mise en œuvre de processus avancés et innovants d'analyse de données bio-informatiques.
* Savoir automatiser le traitement des données : contrôle qualité, imputation, visualisation, etc.
* Savoir mettre en œuvre un traitement reproductible des données (Jupyter, R Markdown)
* Interpréter de façon critique les résultats statistiques dans un domaine centré sur les données massives
* Maîtriser les logiciels de modélisation moléculaire (prédiction de structure 3D, docking, drug design)
* Connaître les principales nouvelles technologies (les données -omiques, de la génomique à la transcriptomique, et la biologie intégrative et des systèmes), les spécificités des données produites par ces technologies et le type d'analyse qui en découle
* Maîtriser les notions, les langages de programmation et des programmes essentiels pour l'analyse de données génomiques (Python, R, shell, applications dédiées) et les applications en médecine de précision ou en génétique des populations
* Comprendre les fondements mathématiques et algorithmiques d'applications en génomique (techniques bayésiennes, chaînes de Markov par exemple pour le phasage des génotypes)
* Savoir mettre en œuvre des méthodes de fouille de données et d'apprentissage statistique (intelligence artificielle) : SVM, réseaux de neurones, deep learning, etc.